Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDO1Q16878 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDO1Q16878 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDO1Q16878 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDO1Q16878 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDO1Q16878 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDO1Q16878 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDO1Q16878 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms