Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CNGA3Q16281 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNGA3Q16281 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNGA3Q16281 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGA3Q16281 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGA3Q16281 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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