Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85BQ15834 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85BQ15834 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC85BQ15834 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC85BQ15834 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC85BQ15834 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms