Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TWIST1Q15672 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWIST1Q15672 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TWIST1Q15672 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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TWIST1Q15672 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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TWIST1Q15672 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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TWIST1Q15672 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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TWIST1Q15672 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWIST1Q15672 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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