Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
MED1Q15648 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MED1Q15648 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MED1Q15648 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
MED1Q15648 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MED1Q15648 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
MED1Q15648 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MED1Q15648 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
MED1Q15648 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MED1Q15648 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MED1Q15648 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
MED1Q15648 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MED1Q15648 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MED1Q15648 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MED1Q15648 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MED1Q15648 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MED1Q15648 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MED1Q15648 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MED1Q15648 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MED1Q15648 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MED1Q15648 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
MED1Q15648 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MED1Q15648 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MED1Q15648 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MED1Q15648 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MED1Q15648 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MED1Q15648 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MED1Q15648 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MED1Q15648 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MED1Q15648 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MED1Q15648 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MED1Q15648 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MED1Q15648 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MED1Q15648 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MED1Q15648 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MED1Q15648 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MED1Q15648 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MED1Q15648 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MED1Q15648 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
MED1Q15648 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MED1Q15648 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MED1Q15648 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
MED1Q15648 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MED1Q15648 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MED1Q15648 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MED1Q15648 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MED1Q15648 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MED1Q15648 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MED1Q15648 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MED1Q15648 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MED1Q15648 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MED1Q15648 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
MED1Q15648 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MED1Q15648 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MED1Q15648 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MED1Q15648 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MED1Q15648 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MED1Q15648 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MED1Q15648 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MED1Q15648 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MED1Q15648 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MED1Q15648 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
MED1Q15648 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
MED1Q15648 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
MED1Q15648 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MED1Q15648 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MED1Q15648 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MED1Q15648 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MED1Q15648 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
MED1Q15648 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
MED1Q15648 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MED1Q15648 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MED1Q15648 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MED1Q15648 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MED1Q15648 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
MED1Q15648 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MED1Q15648 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MED1Q15648 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MED1Q15648 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MED1Q15648 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
MED1Q15648 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MED1Q15648 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MED1Q15648 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MED1Q15648 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MED1Q15648 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms