Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOMM20Q15388 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOMM20Q15388 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOMM20Q15388 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOMM20Q15388 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOMM20Q15388 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOMM20Q15388 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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