Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNIP1Q15025 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIP1Q15025 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNIP1Q15025 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNIP1Q15025 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIP1Q15025 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNIP1Q15025 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNIP1Q15025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms