Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCAPD2Q15021 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCAPD2Q15021 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NCAPD2Q15021 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NCAPD2Q15021 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NCAPD2Q15021 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NCAPD2Q15021 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NCAPD2Q15021 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
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