Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrriq3Q14DL3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrriq3Q14DL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrriq3Q14DL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrriq3Q14DL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrriq3Q14DL3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrriq3Q14DL3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrriq3Q14DL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrriq3Q14DL3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms