Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPNMBQ14956 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPNMBQ14956 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GPNMBQ14956 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPNMBQ14956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPNMBQ14956 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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