Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDC1Q14676 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDC1Q14676 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDC1Q14676 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDC1Q14676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDC1Q14676 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
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