Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLS1Q14651 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLS1Q14651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLS1Q14651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLS1Q14651 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLS1Q14651 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLS1Q14651 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms