Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE1CQ14123 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE1CQ14123 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE1CQ14123 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE1CQ14123 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE1CQ14123 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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