Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COTL1Q14019 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COTL1Q14019 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COTL1Q14019 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COTL1Q14019 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COTL1Q14019 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms