Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALCAMQ13740 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALCAMQ13740 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALCAMQ13740 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALCAMQ13740 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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