Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL4AQ13619 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CUL4AQ13619 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CUL4AQ13619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL4AQ13619 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CUL4AQ13619 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
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