Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX1Q13596 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX1Q13596 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX1Q13596 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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