Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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