Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XRCC4Q13426 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XRCC4Q13426 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC4Q13426 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC4Q13426 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC4Q13426 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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