Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1I2Q13409 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DYNC1I2Q13409 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DYNC1I2Q13409 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1I2Q13409 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DYNC1I2Q13409 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DYNC1I2Q13409 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms