Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP140Q13342 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP140Q13342 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SP140Q13342 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP140Q13342 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SP140Q13342 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP140Q13342 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP140Q13342 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP140Q13342 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP140Q13342 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP140Q13342 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP140Q13342 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP140Q13342 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140Q13342 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140Q13342 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140Q13342 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140Q13342 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140Q13342 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140Q13342 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140Q13342 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140Q13342 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140Q13342 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140Q13342 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SP140Q13342 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SP140Q13342 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SP140Q13342 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP140Q13342 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SP140Q13342 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP140Q13342 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP140Q13342 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SP140Q13342 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP140Q13342 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP140Q13342 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP140Q13342 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP140Q13342 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP140Q13342 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SP140Q13342 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140Q13342 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140Q13342 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140Q13342 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140Q13342 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140Q13342 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP140Q13342 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP140Q13342 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP140Q13342 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP140Q13342 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP140Q13342 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP140Q13342 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP140Q13342 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP140Q13342 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP140Q13342 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140Q13342 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140Q13342 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140Q13342 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140Q13342 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140Q13342 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140Q13342 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140Q13342 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140Q13342 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140Q13342 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140Q13342 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP140Q13342 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP140Q13342 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP140Q13342 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP140Q13342 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP140Q13342 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SP140Q13342 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SP140Q13342 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140Q13342 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140Q13342 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140Q13342 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140Q13342 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140Q13342 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140Q13342 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140Q13342 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140Q13342 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP140Q13342 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP140Q13342 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP140Q13342 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP140Q13342 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP140Q13342 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SP140Q13342 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SP140Q13342 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP140Q13342 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP140Q13342 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP140Q13342 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP140Q13342 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP140Q13342 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140Q13342 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140Q13342 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140Q13342 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140Q13342 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140Q13342 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SP140Q13342 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140Q13342 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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