Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NR1H3Q13133 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NR1H3Q13133 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1H3Q13133 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1H3Q13133 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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