Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIK2Q13002 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK2Q13002 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIK2Q13002 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIK2Q13002 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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