Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HSPB3Q12988 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HSPB3Q12988 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPB3Q12988 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPB3Q12988 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPB3Q12988 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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