Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH17Q12864 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH17Q12864 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH17Q12864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH17Q12864 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH17Q12864 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH17Q12864 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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