Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 ACH1YBL015W 1581 nt9.29□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 YKR012CYKR012C 378 nt9.28□□□□□ -0.92
RTP1Q12751 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 YGR210CYGR210C 1236 nt9.27□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 DMA2YNL116W 1569 nt9.26□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 FCY1YPR062W 477 nt9.26□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 LEU2YCL018W 1095 nt9.25□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 ERO1YML130C 1692 nt9.23□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 YDL086WYDL086W 822 nt9.23□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 ENO1YGR254W 1314 nt9.23□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 GAL2YLR081W 1725 nt9.22□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 YHR218WYHR218W 1812 nt9.22□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 SDS24YBR214W 1584 nt9.22□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 YLR280CYLR280C 351 nt9.22□□□□□ -0.93
RTP1Q12751 CYT1YOR065W 930 nt9.21□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 YRF1-2YER190W 5046 nt9.2□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 MRP1YDR347W 966 nt9.2□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 EDC2YER035W 438 nt9.2□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 EMC3YKL207W 762 nt9.2□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 TOS1YBR162C 1368 nt9.2□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 HOG1YLR113W 1308 nt9.18□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 ODC1YPL134C 933 nt9.18□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 SAC7YDR389W 1965 nt9.17□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 NAM8YHR086W 1572 nt9.17□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 YPL108WYPL108W 507 nt9.17□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 RIM2YBR192W 1134 nt9.17□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 YJL160CYJL160C 864 nt9.16□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 AIM1YAL046C 357 nt9.16□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 YNR064CYNR064C 873 nt9.16□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 SSL2YIL143C 2532 nt9.15□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 ENT4YLL038C 744 nt9.15□□□□□ -0.94
RTP1Q12751 VBA3YCL069W 1377 nt9.14□□□□□ -0.95
RTP1Q12751 YMR206WYMR206W 942 nt9.12□□□□□ -0.95
RTP1Q12751 YMR210WYMR210W 1350 nt9.12□□□□□ -0.95
RTP1Q12751 REX2YLR059C 810 nt9.09□□□□□ -0.95
RTP1Q12751 GID8YMR135C 1368 nt9.09□□□□□ -0.95
RTP1Q12751 HXK1YFR053C 1458 nt9.08□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 URA8YJR103W 1737 nt9.08□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 GTB1YDR221W 2109 nt9.08□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 GDH1YOR375C 1365 nt9.08□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 ALD5YER073W 1563 nt9.07□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 MRS6YOR370C 1812 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 KAE1YKR038C 1161 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 SWT21YNL187W 1074 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 KEL3YPL263C 1956 nt9.06□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 MDM35YKL053C-A 261 nt9.05□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 CWP2YKL096W-A 279 nt9.05□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 TOK1YJL093C 2076 nt9.04□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 YLR046CYLR046C 813 nt9.03□□□□□ -0.96
RTP1Q12751 YFR020WYFR020W 699 nt9.02□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 YHR219WYHR219W 1875 nt9.02□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 YKL133CYKL133C 1392 nt9.01□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 ELO1YJL196C 933 nt9.01□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 HXT10YFL011W 1641 nt9.01□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 ADA2YDR448W 1305 nt9.01□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 LSP1YPL004C 1026 nt9□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 SRP54YPR088C 1626 nt8.99□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 YMR166CYMR166C 1107 nt8.99□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 PRE5YMR314W 705 nt8.99□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 snR31snR31 225 nt8.99□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 SDH8YBR269C 417 nt8.99□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 BAP3YDR046C 1815 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 SFL1YOR140W 2301 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 TAD2YJL035C 753 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 MFT1YML062C 1179 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 YPT11YNL304W 1254 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 NME1NME1 340 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 FRA1YLL029W 2250 nt8.98□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 MET1YKR069W 1782 nt8.97□□□□□ -0.97
RTP1Q12751 PET18YCR020C 648 nt8.95□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 YKL053WYKL053W 375 nt8.95□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 YPL247CYPL247C 1572 nt8.94□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 ELP4YPL101W 1371 nt8.92□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 UTR5YEL035C 501 nt8.92□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 SUV3YPL029W 2214 nt8.92□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 AGP3YFL055W 1677 nt8.91□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 NBA1YOL070C 1506 nt8.91□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 RRT14YIL127C 621 nt8.91□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 YOR072WYOR072W 315 nt8.91□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 HAP5YOR358W 729 nt8.91□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 RPN14YGL004C 1254 nt8.9□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 RSM7YJR113C 744 nt8.9□□□□□ -0.98
RTP1Q12751 DLD3YEL071W 1491 nt8.89□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 YER156CYER156C 1017 nt8.89□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 YMR265CYMR265C 1386 nt8.88□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 ADE1YAR015W 921 nt8.88□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 FUS3YBL016W 1062 nt8.88□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 SAN1YDR143C 1833 nt8.88□□□□□ -0.99
RTP1Q12751 ITR2YOL103W 1830 nt8.88□□□□□ -0.99
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