Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 OYE2YHR179W 1203 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 OCA1YNL099C 717 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 EAF3YPR023C 1206 nt8.04□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RPT5YOR117W 1305 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 CAB5YDR196C 726 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 NEJ1YLR265C 1029 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 AME1YBR211C 975 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 PEX34YCL056C 435 nt8.03□□□□□ -1.12
TY1A-NL1Q12391 RIB3YDR487C 627 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YMR074CYMR074C 438 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 TIF34YMR146C 1044 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YPR150WYPR150W 522 nt8.02□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 HMG2YLR450W 3138 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YER147C-AYER147C-A 411 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 LYS12YIL094C 1116 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YLR111WYLR111W 333 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 VMA11YPL234C 495 nt8.01□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 PHO92YDR374C 921 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 GTT3YEL017W 1014 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 LSM5YER146W 282 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YMR262WYMR262W 942 nt8□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YPR1YDR368W 939 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 LOT5YKL183W 921 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 ERG13YML126C 1476 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 TPS1YBR126C 1488 nt7.99□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YJR056CYJR056C 711 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 TSR2YLR435W 618 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YMR114CYMR114C 1107 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 CWC25YNL245C 540 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 TIP1YBR067C 633 nt7.98□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 YNL040WYNL040W 1371 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 PEX12YMR026C 1200 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 AGP3YFL055W 1677 nt7.96□□□□□ -1.13
TY1A-NL1Q12391 DDI1YER143W 1287 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 YJL055WYJL055W 738 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 SAC7YDR389W 1965 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 YRF1-2YER190W 5046 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 YLR460CYLR460C 1131 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RPC31YNL151C 756 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RIM2YBR192W 1134 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 ALG7YBR243C 1347 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 TPO4YOR273C 1980 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 GLR1YPL091W 1452 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 MIX17YMR002W 471 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 SNX3YOR357C 489 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 PRE2YPR103W 864 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 ESBP6YNL125C 2022 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 HXT12YIL170W 1374 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 VRG4YGL225W 1014 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 TMA23YMR269W 636 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 DSE3YOR264W 1293 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 DPL1YDR294C 1770 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 KRR1YCL059C 951 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 Q0017Q0017 162 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RAI1YGL246C 1164 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 YLR283WYLR283W 945 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RIB7YBR153W 735 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RFC1YOR217W 2586 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 GAL3YDR009W 1563 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 NBA1YOL070C 1506 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 FAR3YMR052W 615 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 RRT8YOL048C 1029 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1A-NL1Q12391 ALD5YER073W 1563 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 HXK1YFR053C 1458 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 ATG22YCL038C 1587 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 SVF1YDR346C 1446 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YCR049CYCR049C 447 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YDL158CYDL158C 309 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 MAF1YDR005C 1188 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 PCP1YGR101W 1041 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 TAZ1YPR140W 1146 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 snR34snR34 203 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 INH1YDL181W 258 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 IMO32YGR031W 1029 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 LEU4YNL104C 1860 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YMR265CYMR265C 1386 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YHR054CYHR054C 1065 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 ELO1YJL196C 933 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 IDP3YNL009W 1263 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YNR064CYNR064C 873 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YMR226CYMR226C 804 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 ADE8YDR408C 645 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 RSA3YLR221C 663 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 YNL319WYNL319W 441 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 HAP5YOR358W 729 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 RIB2YOL066C 1776 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1A-NL1Q12391 GTB1YDR221W 2109 nt7.84□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YMR210WYMR210W 1350 nt7.84□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 NUP57YGR119C 1626 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YOR072WYOR072W 315 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 ILV2YMR108W 2064 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YGR011WYGR011W 327 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 URA8YJR103W 1737 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 SLX1YBR228W 915 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 SUV3YPL029W 2214 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YJR114WYJR114W 393 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YDR467CYDR467C 327 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YPI1YFR003C 468 nt7.8□□□□□ -1.16
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