Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 MTO1YGL236C 2010 nt7.28□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YDR467CYDR467C 327 nt7.27□□□□□ -1.25
USB1Q12208 NAM8YHR086W 1572 nt7.27□□□□□ -1.25
USB1Q12208 YKL053WYKL053W 375 nt7.26□□□□□ -1.25
USB1Q12208 ALR1YOL130W 2580 nt7.25□□□□□ -1.25
USB1Q12208 SBP1YHL034C 885 nt7.25□□□□□ -1.25
USB1Q12208 SRP54YPR088C 1626 nt7.25□□□□□ -1.25
USB1Q12208 THP3YPR045C 1413 nt7.25□□□□□ -1.25
USB1Q12208 KGD2YDR148C 1392 nt7.24□□□□□ -1.25
USB1Q12208 LEU4YNL104C 1860 nt7.24□□□□□ -1.25
USB1Q12208 RTG2YGL252C 1767 nt7.23□□□□□ -1.25
USB1Q12208 AGP3YFL055W 1677 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 YHL008CYHL008C 1884 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 DUR3YHL016C 2208 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 REX2YLR059C 810 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 PAU19YMR325W 375 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 YPT11YNL304W 1254 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 PUP1YOR157C 786 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 SAN1YDR143C 1833 nt7.22□□□□□ -1.25
USB1Q12208 THI6YPL214C 1623 nt7.21□□□□□ -1.26
USB1Q12208 IGD1YFR017C 588 nt7.21□□□□□ -1.26
USB1Q12208 YJL064WYJL064W 396 nt7.21□□□□□ -1.26
USB1Q12208 YKR012CYKR012C 378 nt7.21□□□□□ -1.26
USB1Q12208 GGA2YHR108W 1758 nt7.2□□□□□ -1.26
USB1Q12208 HXK1YFR053C 1458 nt7.2□□□□□ -1.26
USB1Q12208 GPM1YKL152C 744 nt7.2□□□□□ -1.26
USB1Q12208 NAS2YIL007C 663 nt7.19□□□□□ -1.26
USB1Q12208 YBL095WYBL095W 813 nt7.19□□□□□ -1.26
USB1Q12208 GAS1YMR307W 1680 nt7.19□□□□□ -1.26
USB1Q12208 SNU66YOR308C 1764 nt7.18□□□□□ -1.26
USB1Q12208 GCD11YER025W 1584 nt7.18□□□□□ -1.26
USB1Q12208 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.17□□□□□ -1.26
USB1Q12208 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.17□□□□□ -1.26
USB1Q12208 YMC2YBR104W 990 nt7.17□□□□□ -1.26
USB1Q12208 PTC6YCR079W 1329 nt7.16□□□□□ -1.26
USB1Q12208 YDR306CYDR306C 1437 nt7.15□□□□□ -1.27
USB1Q12208 SDS24YBR214W 1584 nt7.15□□□□□ -1.27
USB1Q12208 ADE2YOR128C 1716 nt7.15□□□□□ -1.27
USB1Q12208 LYS20YDL182W 1287 nt7.14□□□□□ -1.27
USB1Q12208 ENO1YGR254W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
USB1Q12208 MOB1YIL106W 945 nt7.14□□□□□ -1.27
USB1Q12208 RSM7YJR113C 744 nt7.14□□□□□ -1.27
USB1Q12208 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.14□□□□□ -1.27
USB1Q12208 THI3YDL080C 1830 nt7.13□□□□□ -1.27
USB1Q12208 ALD5YER073W 1563 nt7.13□□□□□ -1.27
USB1Q12208 NPP2YEL016C 1482 nt7.13□□□□□ -1.27
USB1Q12208 MDL2YPL270W 2322 nt7.12□□□□□ -1.27
USB1Q12208 MRS4YKR052C 915 nt7.12□□□□□ -1.27
USB1Q12208 ADH3YMR083W 1128 nt7.12□□□□□ -1.27
USB1Q12208 NBA1YOL070C 1506 nt7.11□□□□□ -1.27
USB1Q12208 PHB2YGR231C 933 nt7.11□□□□□ -1.27
USB1Q12208 CDD1YLR245C 429 nt7.11□□□□□ -1.27
USB1Q12208 IPL1YPL209C 1104 nt7.11□□□□□ -1.27
USB1Q12208 VBA3YCL069W 1377 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 FLX1YIL134W 936 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 CYC3YAL039C 810 nt7.1□□□□□ -1.27
USB1Q12208 YCR025CYCR025C 411 nt7.08□□□□□ -1.28
USB1Q12208 MAM3YOL060C 2121 nt7.08□□□□□ -1.28
USB1Q12208 AAC3YBR085W 924 nt7.07□□□□□ -1.28
USB1Q12208 AAT1YKL106W 1356 nt7.07□□□□□ -1.28
USB1Q12208 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.06□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YIR035CYIR035C 765 nt7.06□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YLR460CYLR460C 1131 nt7.06□□□□□ -1.28
USB1Q12208 TMS1YDR105C 1422 nt7.06□□□□□ -1.28
USB1Q12208 PUS7YOR243C 2031 nt7.05□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YFR020WYFR020W 699 nt7.05□□□□□ -1.28
USB1Q12208 SRP102YKL154W 735 nt7.05□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YCP4YCR004C 744 nt7.04□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YJL009WYJL009W 327 nt7.04□□□□□ -1.28
USB1Q12208 SLG1YOR008C 1137 nt7.04□□□□□ -1.28
USB1Q12208 EMC3YKL207W 762 nt7.03□□□□□ -1.28
USB1Q12208 YLR280CYLR280C 351 nt7.03□□□□□ -1.28
USB1Q12208 ECM10YEL030W 1935 nt7.03□□□□□ -1.28
USB1Q12208 CHS7YHR142W 951 nt7□□□□□ -1.29
USB1Q12208 BUB2YMR055C 921 nt7□□□□□ -1.29
USB1Q12208 OLA1YBR025C 1185 nt7□□□□□ -1.29
USB1Q12208 YJR149WYJR149W 1215 nt6.99□□□□□ -1.29
USB1Q12208 YOR072WYOR072W 315 nt6.99□□□□□ -1.29
USB1Q12208 TRP2YER090W 1524 nt6.99□□□□□ -1.29
USB1Q12208 ERO1YML130C 1692 nt6.99□□□□□ -1.29
USB1Q12208 snR86snR86 1004 nt6.98□□□□□ -1.29
USB1Q12208 SER2YGR208W 930 nt6.98□□□□□ -1.29
USB1Q12208 FET5YFL041W 1869 nt6.98□□□□□ -1.29
USB1Q12208 HTS1YPR033C 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
USB1Q12208 YEL023CYEL023C 2049 nt6.96□□□□□ -1.29
USB1Q12208 YIA6YIL006W 1122 nt6.96□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt6.95□□□□□ -1.3
USB1Q12208 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.95□□□□□ -1.3
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