Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMAGPQ0VAQ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAGPQ0VAQ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAGPQ0VAQ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms