Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib3Q0P523 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cib3Q0P523 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cib3Q0P523 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms