Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCC8Q09428 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCC8Q09428 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC8Q09428 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC8Q09428 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCC8Q09428 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC8Q09428 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ABCC8Q09428 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC8Q09428 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
ABCC8Q09428 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms