Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RBL2Q08999 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBL2Q08999 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RBL2Q08999 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBL2Q08999 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBL2Q08999 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RBL2Q08999 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms