Protein–RNA interactions for Protein: Q08818

MSC6, Meiotic sister-chromatid recombination protein 6, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSC6Q08818 HRA1HRA1 564 nt9.44□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 AMF1YOR378W 1548 nt9.44□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 DIG1YPL049C 1359 nt9.43□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 YDL086WYDL086W 822 nt9.43□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 LSB6YJL100W 1824 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 PCP1YGR101W 1041 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 SRP102YKL154W 735 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 YKR012CYKR012C 378 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 YPL071CYPL071C 471 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 LEU2YCL018W 1095 nt9.4□□□□□ -0.9
MSC6Q08818 GRH1YDR517W 1119 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YGR210CYGR210C 1236 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YOR268CYOR268C 399 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 PZF1YPR186C 1290 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YPL277CYPL277C 1464 nt9.39□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 SAC7YDR389W 1965 nt9.38□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 HSL7YBR133C 2484 nt9.37□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 SRN2YLR119W 642 nt9.37□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 SDS24YBR214W 1584 nt9.37□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 RPC82YPR190C 1965 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 COX16YJL003W 357 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 ERO1YML130C 1692 nt9.36□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 SPT20YOL148C 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YHR131CYHR131C 2553 nt9.35□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 ENO1YGR254W 1314 nt9.35□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 AIM1YAL046C 357 nt9.35□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 DTR1YBR180W 1719 nt9.34□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 ENT4YLL038C 744 nt9.34□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YLR280CYLR280C 351 nt9.34□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 FCY1YPR062W 477 nt9.34□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 INA1YLR413W 2028 nt9.34□□□□□ -0.91
MSC6Q08818 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt9.33□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 NAM8YHR086W 1572 nt9.33□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 YNR064CYNR064C 873 nt9.32□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 MET2YNL277W 1461 nt9.32□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 VBA3YCL069W 1377 nt9.3□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 MFG1YDL233W 1377 nt9.3□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 EMC3YKL207W 762 nt9.3□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 YPL108WYPL108W 507 nt9.29□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 MRP1YDR347W 966 nt9.28□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 RFC1YOR217W 2586 nt9.28□□□□□ -0.92
MSC6Q08818 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.27□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 YJL160CYJL160C 864 nt9.27□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 MAK32YCR019W 1092 nt9.26□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 HOS2YGL194C 1359 nt9.25□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 YKR023WYKR023W 1593 nt9.25□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 EDC2YER035W 438 nt9.25□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 AST1YBL069W 1290 nt9.25□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 RIM2YBR192W 1134 nt9.25□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 REX2YLR059C 810 nt9.24□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 SWT21YNL187W 1074 nt9.24□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 KEL3YPL263C 1956 nt9.24□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 NPL6YMR091C 1308 nt9.24□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 YMR210WYMR210W 1350 nt9.23□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 YLR046CYLR046C 813 nt9.22□□□□□ -0.93
MSC6Q08818 YCR049CYCR049C 447 nt9.21□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 CCT2YIL142W 1584 nt9.2□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 NPP1YCR026C 2229 nt9.2□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 ELO1YJL196C 933 nt9.2□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 ILV2YMR108W 2064 nt9.2□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 SFL1YOR140W 2301 nt9.2□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 SCO2YBR024W 906 nt9.19□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 UTP6YDR449C 1323 nt9.19□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 YFR020WYFR020W 699 nt9.18□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 HOG1YLR113W 1308 nt9.18□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 TOS1YBR162C 1368 nt9.18□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 SFP1YLR403W 2052 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 HEL2YDR266C 1920 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 EHD3YDR036C 1503 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 GDH1YOR375C 1365 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 YMR147WYMR147W 672 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 OPI10YOL032W 741 nt9.17□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 MET1YKR069W 1782 nt9.16□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 SRP54YPR088C 1626 nt9.16□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 BMT5YIL096C 1011 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 YOR325WYOR325W 474 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 snR31snR31 225 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 HXT10YFL011W 1641 nt9.15□□□□□ -0.94
MSC6Q08818 YKL053WYKL053W 375 nt9.14□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 YMR206WYMR206W 942 nt9.14□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 ILV3YJR016C 1758 nt9.14□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 APM1YPL259C 1428 nt9.14□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 SUV3YPL029W 2214 nt9.13□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 KAE1YKR038C 1161 nt9.12□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 YPT11YNL304W 1254 nt9.12□□□□□ -0.95
MSC6Q08818 LSP1YPL004C 1026 nt9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms