Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD47Q08722 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD47Q08722 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD47Q08722 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD47Q08722 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD47Q08722 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD47Q08722 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD47Q08722 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD47Q08722 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD47Q08722 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD47Q08722 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD47Q08722 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD47Q08722 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD47Q08722 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD47Q08722 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD47Q08722 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD47Q08722 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD47Q08722 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD47Q08722 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD47Q08722 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD47Q08722 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD47Q08722 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD47Q08722 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD47Q08722 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD47Q08722 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD47Q08722 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD47Q08722 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD47Q08722 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD47Q08722 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD47Q08722 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD47Q08722 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD47Q08722 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD47Q08722 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD47Q08722 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD47Q08722 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD47Q08722 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD47Q08722 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD47Q08722 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD47Q08722 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD47Q08722 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD47Q08722 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD47Q08722 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD47Q08722 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD47Q08722 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD47Q08722 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD47Q08722 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD47Q08722 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD47Q08722 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD47Q08722 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD47Q08722 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD47Q08722 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD47Q08722 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD47Q08722 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD47Q08722 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD47Q08722 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD47Q08722 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD47Q08722 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD47Q08722 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD47Q08722 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD47Q08722 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD47Q08722 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD47Q08722 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD47Q08722 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD47Q08722 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD47Q08722 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD47Q08722 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD47Q08722 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD47Q08722 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD47Q08722 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD47Q08722 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD47Q08722 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD47Q08722 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD47Q08722 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD47Q08722 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD47Q08722 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD47Q08722 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD47Q08722 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD47Q08722 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1155.7 ms