Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp2Q08652 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp2Q08652 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp2Q08652 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp2Q08652 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp2Q08652 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp2Q08652 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms