Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4F3Q08477 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F3Q08477 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CYP4F3Q08477 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F3Q08477 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F3Q08477 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms