Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gata4Q08369 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gata4Q08369 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gata4Q08369 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gata4Q08369 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gata4Q08369 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata4Q08369 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms