Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cnn1Q08091 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn1Q08091 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnn1Q08091 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnn1Q08091 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnn1Q08091 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms