Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTN3Q08043 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN3Q08043 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN3Q08043 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN3Q08043 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN3Q08043 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN3Q08043 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms