Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SOS1Q07889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOS1Q07889 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SOS1Q07889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SOS1Q07889 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SOS1Q07889 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SOS1Q07889 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SOS1Q07889 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SOS1Q07889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOS1Q07889 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOS1Q07889 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOS1Q07889 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SOS1Q07889 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SOS1Q07889 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOS1Q07889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SOS1Q07889 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOS1Q07889 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOS1Q07889 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SOS1Q07889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOS1Q07889 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOS1Q07889 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SOS1Q07889 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOS1Q07889 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SOS1Q07889 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOS1Q07889 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms