Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLEQ07864 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLEQ07864 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLEQ07864 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLEQ07864 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLEQ07864 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLEQ07864 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLEQ07864 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLEQ07864 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLEQ07864 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLEQ07864 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLEQ07864 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLEQ07864 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLEQ07864 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLEQ07864 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLEQ07864 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLEQ07864 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLEQ07864 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLEQ07864 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLEQ07864 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLEQ07864 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLEQ07864 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLEQ07864 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLEQ07864 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLEQ07864 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLEQ07864 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLEQ07864 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLEQ07864 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLEQ07864 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLEQ07864 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLEQ07864 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLEQ07864 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLEQ07864 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLEQ07864 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLEQ07864 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLEQ07864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLEQ07864 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLEQ07864 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLEQ07864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLEQ07864 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLEQ07864 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLEQ07864 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLEQ07864 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLEQ07864 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLEQ07864 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLEQ07864 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLEQ07864 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLEQ07864 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLEQ07864 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLEQ07864 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLEQ07864 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLEQ07864 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLEQ07864 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLEQ07864 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLEQ07864 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLEQ07864 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLEQ07864 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLEQ07864 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLEQ07864 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLEQ07864 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POLEQ07864 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLEQ07864 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLEQ07864 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLEQ07864 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLEQ07864 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLEQ07864 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLEQ07864 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLEQ07864 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLEQ07864 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLEQ07864 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLEQ07864 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLEQ07864 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLEQ07864 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLEQ07864 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLEQ07864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLEQ07864 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLEQ07864 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms