Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nfe2Q07279 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nfe2Q07279 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nfe2Q07279 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nfe2Q07279 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nfe2Q07279 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nfe2Q07279 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nfe2Q07279 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nfe2Q07279 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms