Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prrx2Q06348 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrx2Q06348 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrx2Q06348 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrx2Q06348 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrx2Q06348 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrx2Q06348 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms