Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Caprin2Q05A80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Caprin2Q05A80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Caprin2Q05A80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caprin2Q05A80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Caprin2Q05A80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caprin2Q05A80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms