Protein–RNA interactions for Protein: Q05166

ASM4, Nucleoporin ASM4, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ASM4Q05166 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 IMO32YGR031W 1029 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 SNX3YOR357C 489 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 DPL1YDR294C 1770 nt7.37□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 MIM1YOL026C 342 nt7.36□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 MDL2YPL270W 2322 nt7.36□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 YPL277CYPL277C 1464 nt7.35□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 ADE8YDR408C 645 nt7.34□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 ELO1YJL196C 933 nt7.34□□□□□ -1.23
ASM4Q05166 RRT8YOL048C 1029 nt7.33□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 NPP2YEL016C 1482 nt7.32□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 AAC3YBR085W 924 nt7.32□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 APM1YPL259C 1428 nt7.32□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 FET5YFL041W 1869 nt7.32□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 THI72YOR192C 1800 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YJR114WYJR114W 393 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 SNZ1YMR096W 894 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YMR147WYMR147W 672 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 DAK2YFL053W 1776 nt7.31□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 KRR1YCL059C 951 nt7.3□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YDR467CYDR467C 327 nt7.3□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 SCO2YBR024W 906 nt7.3□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 DTR1YBR180W 1719 nt7.3□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YJL107CYJL107C 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YNR064CYNR064C 873 nt7.29□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YRF1-2YER190W 5046 nt7.29□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 RSM23YGL129C 1353 nt7.29□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YCR049CYCR049C 447 nt7.28□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 SEM1YDR363W-A 270 nt7.28□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 OPI3YJR073C 621 nt7.28□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 NPL6YMR091C 1308 nt7.27□□□□□ -1.24
ASM4Q05166 YJL195CYJL195C 702 nt7.27□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 HBS1YKR084C 1836 nt7.26□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 TRP2YER090W 1524 nt7.26□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 YMR265CYMR265C 1386 nt7.25□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 MAK32YCR019W 1092 nt7.25□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 YPR126CYPR126C 309 nt7.25□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 CCT5YJR064W 1689 nt7.25□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 SUV3YPL029W 2214 nt7.24□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 ARP10YDR106W 855 nt7.24□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 KEL3YPL263C 1956 nt7.24□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 MTO1YGL236C 2010 nt7.23□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 TVP23YDR084C 600 nt7.23□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.23□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.23□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 HAP5YOR358W 729 nt7.23□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 CTI6YPL181W 1521 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 YKR023WYKR023W 1593 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 UFD1YGR048W 1086 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 SPS100YHR139C 981 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 IML3YBR107C 738 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 SIR2YDL042C 1689 nt7.22□□□□□ -1.25
ASM4Q05166 THI6YPL214C 1623 nt7.21□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 RPN14YGL004C 1254 nt7.21□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 EHD3YDR036C 1503 nt7.21□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 SFL1YOR140W 2301 nt7.21□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 DUR3YHL016C 2208 nt7.2□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 snR4snR4 186 nt7.2□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 ILV2YMR108W 2064 nt7.2□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 ORT1YOR130C 879 nt7.19□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 ENO2YHR174W 1314 nt7.19□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 HXT11YOL156W 1704 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 FIT1YDR534C 1587 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 FUN14YAL008W 597 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 EMC3YKL207W 762 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 CRC1YOR100C 984 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 DUS3YLR401C 2007 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 MET1YKR069W 1782 nt7.18□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YHR145CYHR145C 357 nt7.17□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 AAT1YKL106W 1356 nt7.17□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YGL118CYGL118C 438 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YBL095WYBL095W 813 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YNR068CYNR068C 819 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 snR31snR31 225 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 ALG7YBR243C 1347 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 ICE2YIL090W 1476 nt7.16□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YEL008WYEL008W 381 nt7.15□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 YKL053WYKL053W 375 nt7.15□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 GPM1YKL152C 744 nt7.15□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 SKG1YKR100C 1068 nt7.15□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 SWT21YNL187W 1074 nt7.15□□□□□ -1.26
ASM4Q05166 SRM1YGL097W 1449 nt7.15□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 GTB1YDR221W 2109 nt7.15□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 SNU71YGR013W 1863 nt7.14□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 YBL081WYBL081W 1107 nt7.14□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 AMF1YOR378W 1548 nt7.14□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 THP3YPR045C 1413 nt7.14□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 YMC2YBR104W 990 nt7.14□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 PIC2YER053C 903 nt7.13□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 MHF1YOL086W-A 273 nt7.13□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 ECM27YJR106W 2178 nt7.12□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 KGD2YDR148C 1392 nt7.12□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 POP2YNR052C 1302 nt7.12□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 RRP1YDR087C 837 nt7.12□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 TPC1YGR096W 945 nt7.12□□□□□ -1.27
ASM4Q05166 MRS3YJL133W 945 nt7.12□□□□□ -1.27
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