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Protein–RNA interactions for Protein: Q05166
ASM4, Nucleoporin ASM4, yeast
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528 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ASM4
Q05166
tD(GUC)L1
tD(GUC)L1
72 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
tD(GUC)L2
tD(GUC)L2
72 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
tD(GUC)M
tD(GUC)M
72 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
tD(GUC)O
tD(GUC)O
72 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
IMO32
YGR031W
1029 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
SNX3
YOR357C
489 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
DPL1
YDR294C
1770 nt
7.37
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
MIM1
YOL026C
342 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
MDL2
YPL270W
2322 nt
7.36
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
YPL277C
YPL277C
1464 nt
7.35
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
ADE8
YDR408C
645 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
ELO1
YJL196C
933 nt
7.34
□□□□□ -1.23
ASM4
Q05166
RRT8
YOL048C
1029 nt
7.33
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
NPP2
YEL016C
1482 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
AAC3
YBR085W
924 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
APM1
YPL259C
1428 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
FET5
YFL041W
1869 nt
7.32
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
THI72
YOR192C
1800 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YFR036W-A
YFR036W-A
651 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YJR114W
YJR114W
393 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
SNZ1
YMR096W
894 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YMR147W
YMR147W
672 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
DAK2
YFL053W
1776 nt
7.31
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
KRR1
YCL059C
951 nt
7.3
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YDR467C
YDR467C
327 nt
7.3
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
SCO2
YBR024W
906 nt
7.3
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
DTR1
YBR180W
1719 nt
7.3
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YJL107C
YJL107C
1164 nt
7.29
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YNR064C
YNR064C
873 nt
7.29
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YRF1-2
YER190W
5046 nt
7.29
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
RSM23
YGL129C
1353 nt
7.29
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YCR049C
YCR049C
447 nt
7.28
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
SEM1
YDR363W-A
270 nt
7.28
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
OPI3
YJR073C
621 nt
7.28
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
NPL6
YMR091C
1308 nt
7.27
□□□□□ -1.24
ASM4
Q05166
YJL195C
YJL195C
702 nt
7.27
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
HBS1
YKR084C
1836 nt
7.26
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
TRP2
YER090W
1524 nt
7.26
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
YMR265C
YMR265C
1386 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
MAK32
YCR019W
1092 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
YPR126C
YPR126C
309 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
CCT5
YJR064W
1689 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
SUV3
YPL029W
2214 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
ARP10
YDR106W
855 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
KEL3
YPL263C
1956 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
MTO1
YGL236C
2010 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
TVP23
YDR084C
600 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
tE(CUC)D
tE(CUC)D
72 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
tE(CUC)I
tE(CUC)I
72 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
HAP5
YOR358W
729 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
CTI6
YPL181W
1521 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
YKR023W
YKR023W
1593 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
UFD1
YGR048W
1086 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
SPS100
YHR139C
981 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
IML3
YBR107C
738 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
SIR2
YDL042C
1689 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ASM4
Q05166
THI6
YPL214C
1623 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
RPN14
YGL004C
1254 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
EHD3
YDR036C
1503 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
SFL1
YOR140W
2301 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
DUR3
YHL016C
2208 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
snR4
snR4
186 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
ILV2
YMR108W
2064 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
ORT1
YOR130C
879 nt
7.19
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
ENO2
YHR174W
1314 nt
7.19
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
HXT11
YOL156W
1704 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
FIT1
YDR534C
1587 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
FUN14
YAL008W
597 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
EMC3
YKL207W
762 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
CRC1
YOR100C
984 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
DUS3
YLR401C
2007 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
MET1
YKR069W
1782 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YHR145C
YHR145C
357 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
AAT1
YKL106W
1356 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YGL118C
YGL118C
438 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YBL095W
YBL095W
813 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YNR068C
YNR068C
819 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
snR31
snR31
225 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
ALG7
YBR243C
1347 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
ICE2
YIL090W
1476 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YEL008W
YEL008W
381 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
YKL053W
YKL053W
375 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
GPM1
YKL152C
744 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
SKG1
YKR100C
1068 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
SWT21
YNL187W
1074 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ASM4
Q05166
SRM1
YGL097W
1449 nt
7.15
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
GTB1
YDR221W
2109 nt
7.15
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
SNU71
YGR013W
1863 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
YBL081W
YBL081W
1107 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
AMF1
YOR378W
1548 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
THP3
YPR045C
1413 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
YMC2
YBR104W
990 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
PIC2
YER053C
903 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
MHF1
YOL086W-A
273 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
ECM27
YJR106W
2178 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
KGD2
YDR148C
1392 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
POP2
YNR052C
1302 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
RRP1
YDR087C
837 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
TPC1
YGR096W
945 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ASM4
Q05166
MRS3
YJL133W
945 nt
7.12
□□□□□ -1.27
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