Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSTF1Q05048 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSTF1Q05048 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSTF1Q05048 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSTF1Q05048 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CSTF1Q05048 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms