Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 MET1YKR069W 1782 nt8.11□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 THI3YDL080C 1830 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 KGD2YDR148C 1392 nt8.1□□□□□ -1.11
YMR226CQ05016 YLR072WYLR072W 2082 nt8.08□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.08□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 DIA4YHR011W 1341 nt8.07□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 MRS4YKR052C 915 nt8.07□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 YNR029CYNR029C 1290 nt8.07□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 SBP1YHL034C 885 nt8.05□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 FTH1YBR207W 1398 nt8.05□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 SNZ1YMR096W 894 nt8.04□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 YPR126CYPR126C 309 nt8.04□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 TPN1YGL186C 1740 nt8.03□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 LEA1YPL213W 717 nt8.03□□□□□ -1.12
YMR226CQ05016 SPS100YHR139C 981 nt8.02□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 TOK1YJL093C 2076 nt8.02□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 LPD1YFL018C 1500 nt8.02□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 PFS2YNL317W 1398 nt8.01□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 YKL053WYKL053W 375 nt8.01□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 AMF1YOR378W 1548 nt8.01□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 snR86snR86 1004 nt8□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 ESS1YJR017C 513 nt8□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 ADH1YOL086C 1047 nt8□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 AAC3YBR085W 924 nt8□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 SAN1YDR143C 1833 nt8□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 RBG2YGR173W 1107 nt7.99□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 IML3YBR107C 738 nt7.98□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 ABZ2YMR289W 1125 nt7.97□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 ENO2YHR174W 1314 nt7.97□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 CCT5YJR064W 1689 nt7.96□□□□□ -1.13
YMR226CQ05016 MDH2YOL126C 1134 nt7.96□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 CTI6YPL181W 1521 nt7.94□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 SLM3YDL033C 1254 nt7.94□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 HIS3YOR202W 663 nt7.94□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 HSV2YGR223C 1347 nt7.94□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 TMS1YDR105C 1422 nt7.93□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 ABP1YCR088W 1779 nt7.92□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 GAS1YMR307W 1680 nt7.9□□□□□ -1.14
YMR226CQ05016 SRP54YPR088C 1626 nt7.89□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 LEU2YCL018W 1095 nt7.89□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 PAR32YDL173W 888 nt7.88□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 MET30YIL046W 1923 nt7.88□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 YJL009WYJL009W 327 nt7.87□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 YNL190WYNL190W 615 nt7.87□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 PMT7YDR307W 1989 nt7.86□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 NDE2YDL085W 1638 nt7.86□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 PTC6YCR079W 1329 nt7.86□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 MHF1YOL086W-A 273 nt7.86□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 FRA1YLL029W 2250 nt7.86□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 TIF3YPR163C 1311 nt7.85□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 LYS20YDL182W 1287 nt7.84□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 TPC1YGR096W 945 nt7.84□□□□□ -1.15
YMR226CQ05016 NAM8YHR086W 1572 nt7.83□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.82□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 AIM34YMR003W 597 nt7.82□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YNL140CYNL140C 570 nt7.82□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 NSG2YNL156C 900 nt7.82□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YPT11YNL304W 1254 nt7.82□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 GNP1YDR508C 1992 nt7.81□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YDR306CYDR306C 1437 nt7.81□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 REX2YLR059C 810 nt7.81□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YBR056WYBR056W 1506 nt7.81□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YJL195CYJL195C 702 nt7.8□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 YIR035CYIR035C 765 nt7.79□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 ITR1YDR497C 1755 nt7.79□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 LAS17YOR181W 1902 nt7.78□□□□□ -1.16
YMR226CQ05016 BUD31YCR063W 474 nt7.77□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 GLY1YEL046C 1164 nt7.77□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 INM1YHR046C 888 nt7.77□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 POT1YIL160C 1254 nt7.77□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 BUB2YMR055C 921 nt7.77□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 PRC1YMR297W 1599 nt7.76□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 MEP1YGR121C 1479 nt7.75□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.75□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 TAF13YML098W 504 nt7.75□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 YPL264CYPL264C 1062 nt7.75□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 TGL5YOR081C 2250 nt7.75□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 MRN1YPL184C 1839 nt7.74□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 YJR149WYJR149W 1215 nt7.74□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 INO1YJL153C 1602 nt7.74□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 WSC4YHL028W 1818 nt7.73□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 TDA4YJR116W 840 nt7.73□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 BEM1YBR200W 1656 nt7.73□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 YEL008WYEL008W 381 nt7.72□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 MET13YGL125W 1803 nt7.72□□□□□ -1.17
YMR226CQ05016 RRT6YGL146C 936 nt7.71□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 SPE4YLR146C 903 nt7.71□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 HXT9YJL219W 1704 nt7.7□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 LRO1YNR008W 1986 nt7.7□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 NIF3YGL221C 867 nt7.7□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 FUN14YAL008W 597 nt7.7□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 ATP10YLR393W 840 nt7.7□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 RSM7YJR113C 744 nt7.69□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 TOP3YLR234W 1971 nt7.68□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 CHA1YCL064C 1083 nt7.68□□□□□ -1.18
YMR226CQ05016 ALR1YOL130W 2580 nt7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.4 ms