Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMX1Q04741 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMX1Q04741 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX1Q04741 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX1Q04741 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX1Q04741 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms