Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarcad1Q04692 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcad1Q04692 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarcad1Q04692 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarcad1Q04692 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarcad1Q04692 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcad1Q04692 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcad1Q04692 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms