Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 DMA2YNL116W 1569 nt10.15□□□□□ -0.78
CSI1Q04368 YCP4YCR004C 744 nt10.15□□□□□ -0.78
CSI1Q04368 SBP1YHL034C 885 nt10.15□□□□□ -0.78
CSI1Q04368 PTC6YCR079W 1329 nt10.14□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 YLR280CYLR280C 351 nt10.14□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 GAS1YMR307W 1680 nt10.14□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 LEU4YNL104C 1860 nt10.14□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.13□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 ERO1YML130C 1692 nt10.12□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 THI3YDL080C 1830 nt10.12□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 SRP102YKL154W 735 nt10.12□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 YFR020WYFR020W 699 nt10.11□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 YPT11YNL304W 1254 nt10.11□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 HXT10YFL011W 1641 nt10.09□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.09□□□□□ -0.79
CSI1Q04368 HTS1YPR033C 1641 nt10.08□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 YGR210CYGR210C 1236 nt10.08□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 YDR467CYDR467C 327 nt10.07□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 GPM1YKL152C 744 nt10.07□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 GGA2YHR108W 1758 nt10.06□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 YHR218WYHR218W 1812 nt10.05□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.04□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.04□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 HEL2YDR266C 1920 nt10.03□□□□□ -0.8
CSI1Q04368 YIA6YIL006W 1122 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 FCY1YPR062W 477 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 PSD1YNL169C 1503 nt10.02□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 AGP3YFL055W 1677 nt10□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 RSM7YJR113C 744 nt9.99□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 ERG6YML008C 1152 nt9.99□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 RIB1YBL033C 1038 nt9.99□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 YPL108WYPL108W 507 nt9.99□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 NPP2YEL016C 1482 nt9.98□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 SOD2YHR008C 702 nt9.98□□□□□ -0.81
CSI1Q04368 YMR007WYMR007W 381 nt9.96□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 YBL095WYBL095W 813 nt9.95□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 INH1YDL181W 258 nt9.94□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 YJL160CYJL160C 864 nt9.93□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 CYT1YOR065W 930 nt9.92□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 AAC3YBR085W 924 nt9.92□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 PET18YCR020C 648 nt9.91□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 YMR166CYMR166C 1107 nt9.91□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 MET22YOL064C 1074 nt9.91□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 LSP1YPL004C 1026 nt9.91□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 RNA170RNA170 169 nt9.9□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 YMC2YBR104W 990 nt9.9□□□□□ -0.82
CSI1Q04368 CAK1YFL029C 1107 nt9.88□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 TMS1YDR105C 1422 nt9.87□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 OCH1YGL038C 1443 nt9.86□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 AAT1YKL106W 1356 nt9.86□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 YJR149WYJR149W 1215 nt9.85□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 EMC3YKL207W 762 nt9.85□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 MRS4YKR052C 915 nt9.85□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 YLR460CYLR460C 1131 nt9.85□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 RCR1YBR005W 642 nt9.85□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 MAE1YKL029C 2010 nt9.84□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 YMR210WYMR210W 1350 nt9.84□□□□□ -0.83
CSI1Q04368 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.83□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 MTO1YGL236C 2010 nt9.82□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 CHS7YHR142W 951 nt9.82□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 PDC6YGR087C 1692 nt9.82□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 TPN1YGL186C 1740 nt9.82□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 FET5YFL041W 1869 nt9.81□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 POP2YNR052C 1302 nt9.81□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 UTR5YEL035C 501 nt9.8□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 RRT14YIL127C 621 nt9.8□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 YIR035CYIR035C 765 nt9.8□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 YBR056WYBR056W 1506 nt9.8□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 MEP1YGR121C 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 snR86snR86 1004 nt9.78□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 BUB2YMR055C 921 nt9.78□□□□□ -0.84
CSI1Q04368 YJL009WYJL009W 327 nt9.77□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 OLA1YBR025C 1185 nt9.77□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 TRP2YER090W 1524 nt9.77□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 BXI1YNL305C 894 nt9.75□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 RPS6AYPL090C 711 nt9.75□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 RPS6BYBR181C 711 nt9.75□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 THI6YPL214C 1623 nt9.74□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 YER156CYER156C 1017 nt9.74□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 YLR072WYLR072W 2082 nt9.73□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 SHC1YER096W 1539 nt9.73□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 RHO1YPR165W 630 nt9.73□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 TPO4YOR273C 1980 nt9.72□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 GRH1YDR517W 1119 nt9.72□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 PAU21YOR394W 495 nt9.72□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 PAU22YPL282C 495 nt9.72□□□□□ -0.85
CSI1Q04368 NBA1YOL070C 1506 nt9.71□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 HXT11YOL156W 1704 nt9.7□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 ADA2YDR448W 1305 nt9.69□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 THI73YLR004C 1572 nt9.67□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 BUD20YLR074C 501 nt9.67□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 MFT1YML062C 1179 nt9.67□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 YHL008CYHL008C 1884 nt9.67□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 LRO1YNR008W 1986 nt9.66□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 EHT1YBR177C 1356 nt9.65□□□□□ -0.86
CSI1Q04368 SRM1YGL097W 1449 nt9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.6 ms